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国家级自然保护区是自然生态最优质、生物多样性最丰富的地方。为解决中央环保督察暴露出保护区管理方面的问题，五里坡管理中心坚持问题导向，着力依法保护，提升治理水平和治理能力。

机构上划，解决管理体制的问题。2019年，重庆市辖区内所有国家级自然保护区上划市林业局直管，五里坡自上划后，理顺管理体制，解决了过去 “不好管”的问题。现在，保护区内项目的规划、建设，基本上要事先咨询五里坡管理中心；同时，勇于直面违法违规问题线索并及时移送。

一区一法，解决职责不明的问题。以中央生态环保督察问题整改为契机，五里坡管理中心牵头起草《重庆五里坡国家级自然保护区管理办法》，由市林业局和巫山县人民政府联合印发，明确了属地、属事管理责任。保护区实行综合管理、监督管理与分部门管理相结合的管理体制，明确了不同性质违法案件的执法主体机构，保护区管理机构按照市委编办确定的职责认真履职，形成了各司其职、齐抓共管的格局。同时，县政府还印发了《关于进一步加强重庆五里坡国家级自然保护区农村房屋建设管理工作的通知》。

司法协作，解决履职不力的问题。自然生态的系统保护、合理利用，需要多方面协作。五里坡管理中心与县检察院签订《联合建立五里坡国家级自然保护区生态环境保护协作机制实施办法》，在全国率先设立“生态检察官办公室”，检察院用生态公益诉讼职责督促相关单位履职。一年多来，已开展联合巡查56人次、警示案例教育6场次、抄送函2件。