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重要外来入侵昆虫刺槐叶瘿蚊基因组研究取得新进展

2025-01-13   来源：中国林科院

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生物入侵是当今全球面临的主要生态问题之一，对生态环境、社会经济和人类健康产生了重大影响，迫切需要加强外来入侵种相关领域的深入研究，为外来入侵种长效防控提供科学依据。重要外来入侵昆虫刺槐叶瘿蚊（Obolodiplosis robiniae）原产北美东部地区，近20年来，迅速在欧洲和亚洲扩散蔓延，严重危害刺槐属植物，给当地林业生产和景观生态造成损失，同时也严重破坏我国园林绿化成果。从分子水平研究入侵种的遗传、进化及入侵性相关特征，探讨入侵种内在适应性机制，是了解掌握外来种成功入侵的重要环节。

本研究运用Illumina、PacBio HiFi和Hi-C技术，在染色体水平上组装了刺槐叶瘿蚊高质量基因组。组装的基因组大小为199.49Mb，contig N50为4.66Mb。经过Hi-C搭建，contigs被组装到4条染色体上，比对率大于98%。scaffold N50长度为47.6Mb，通用单拷贝同源基因基准（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologues，BUSCO）值为90.3%。通过注释，发现基因组包含15055个蛋白质编码基因。该研究结果将为下一步开展刺槐叶瘿蚊进化、入侵性特征以及与专性天敌互作关系研究提供理论依据，进而为实施有效的检疫管理与防控策略奠定基础。

研究结果以“The chromosome-level genome assembly and annotation of an invasive forest pestObolodiplosis robiniae”为题，于2024年11月发表在《Scientific Data》（JCR 1区，IF=5.8）。中国林科院森环森保所植物检疫与外来有害生物学科组已毕业硕士研究生黄岚为论文第一作者，姚艳霞研究员和北京市农林科学院魏书军研究员为论文共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金和中国林业科学研究院基本科研业务费专项项目的共同资助。（黄岚 林若竹）