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在中国科学院昆明动物研究所的帮助下剑湖湿地省级自然保护区管护局成功完成了剑湖流域鱼类资源调查工作。

（1）在剑湖流域共记录分布有鱼类26种，隶属于7目10科20属，实际采集到鱼类13种，隶属于7目7科11属。所采集的的鱼类中，有两种为未定种，分别为高原鳅属一种和荷马条鳅属一种。

（2）外来鱼类占据本地渔获物的绝对主体，主要有池沼公鱼、麦穗鱼、棒花鱼、鰕虎鱼、黄黝鱼等。

（3）剑湖湖体鱼类优势种类主要是池沼公鱼、小黄黝鱼、麦穗鱼、棒花鱼、鲫鱼，这几种鱼类耐污能力、繁殖力强，最终占据渔获物数量的70%以上。

（4）剑湖流域目前无国家级、省级保护鱼类；IUCN红色名录收录1种，即杞麓鲤，评级为濒危（EN），《中国物种红色名录》收录1种，即灰裂腹鱼；剑湖流域特有鱼类1种，剑川高原鳅；重要土著鱼类有杞麓鲤、光唇裂腹鱼、后背鲈鲤；这些鱼类均未采集到实体标本，鱼类资源量已经稀少。

（5）鱼类栖息地质量整体较差，剑湖流域主要水体即剑湖湖体和漾濞江干流，剑湖湖体水质较差，外来种占据了绝对主体，漾濞江流经密集的农田、村庄，农业面源污染严重，加之河道整修，已经丧失了原有生境，鱼类数量极少。
                   麦穗鱼Pseudorasbora parva、

                    棒花鱼Abbottina rivularis

                   高体鳑鲏Rhodeus ocellatus

                       鲫鲤Cyprinus carpio

                    池沼公鱼Hypomesus olidus

                  剑川高原鳅Triplophysa jianchuanensis